Fueron consideradas algas verde-azules en el pasado, porque en muchas especies es común su color azul turquesa o verde esmeralda, además de presentar fotosíntesis oxigénica, sin embargo, actualmente se han separado de las algas por su comprobada cercanía genética con las bacterias, por lo que se les llama cianobacterias o bacterias azules.
Esta cianobacteria forma colonias mucilaginosas microscópicas sin forma definida. Las colonias se integran de numerosas células que se reproducen por división transversal, son de forma cilíndrica alargada, rectas y curvas que están dispersas de manera irregular en el denso mucilago extracelular. Es de resaltar que estos organismos tienen la capacidad de fijar el CO2 del ambiente, lo cual representa una gran relevancia para el balance global de carbono.
Gloemargarita Lithophora es uno de los protagonistas importantes en Alchichica por su biología tan novedosa y por su asociación con los microbialitos, ya que juego un papel muy importante en la biomineralización, que se distingue en Alchichica por el depósito masivo de carbonatos.
