Het hoofdgebouw van de Humboldt universiteit is gevestigd in het voormalige Paleis van Prins Heinrich. Hij was de jongere broer van de latere Pruisische koning Frederik de Grote. Koning Friedrich-Wilhelm III schonk het paleis in 1809 aan de universiteit die toen net was opgericht. Tot 1949 heette de Humboldt universiteit uit dankbaarheid dan ook Friedrich-Wilhelms-Universität. Maar deze naam strookte niet met de DDR filosofie. In 1949 werd de universiteit omgedoopt in de Humboldt Universiteit. Naar de broers Wilhelm en Alexander von Humboldt, respectievelijk onderwijshervormer en natuurwetenschapper.