Экспозиция Дома генерального судьи Василия Кочубея состоит из нескольких тематических разделов и дает разностороннее представление об этом историческом здании и связанных с ним личностей.
Открывает экспозицию зал, который знакомит с историей строительства и использования дома и усадьбы от XVII века и до сегодняшнего дня. Тема раскрыта историческими реконструкциями и фотографиями, а также оригинальными предметами – замками и ключами XVII-XVIII веков.
Знакомство с собственниками усадьбы – Кочубеями – начинается с личности Василия Кочубея – генерального писаря и судьи Войска Запорожского. Родовое дерево и портреты отдельных членов семьи представляют роль Кочубеев в жизни страны. Отдельная часть експозиции посвящена автору славной казаческой Летописи – Самуилу Величко. Он в свое время также проживал здесь.
Тема любви Матроны Кочубей и гетмана Ивана Мазепы вызывает едва ли не наибольшую заинтересованность посетителей, поэтому ей посвящен отдельный зал. Центральное место в ней занимают письма гетмана к любимой. В экспозиции собрано изображение Мотри Кочубей, а также произведения современных художников – гравюры Василия Лопаты и офорты Сергея Якутовича. Украшение зала – икона «Богоматерь», которую в 1707 году гетьман Иван Мазепа подарил церкви города Жолквы.
Четвертый экспозицонный зал знакомит с историей последнего собственника усадьбы Кочубеев – Василя Петровича Кочубея. Тут воссоздан интерьер жилища украинской аристократии начала ХХ в. Он дополнен семейными фотографиями на стенах, что создает атмосферу уюта и душевного покоя.
