Эфес сквозь века.
В этом разделе музея представлена история расселения человека в районе Эфеса. Выставленные здесь экспонаты расположены в соответствии с хронологическим порядком.
Самыми древними артефактами в музее являются сосуды из микенской гробницы, обнаруженные случайно, во время строительства автостоянки у базилики Святого Иоанна. Посуда, найденная в гробнице, датируется 14 и 13 веками до нашей эры. Среди более мелких предметов есть бронзовые мечи и наконечники копий, терракотовые сосуды и статуэтки, стеклянные бутылки и колбы.