Официальной точкой отсчёта истории Казахстанского института стратегических исследований является 16 июня 1993 года, когда институтом был создан указом президента Казахстана Нурсултана Назарбаева в целях прогнозно-аналитического обеспечения стратегических аспектов внешней и внутренней политики Казахстана.
Большая заслуга в появлении центра и преобразовании его в полноценный институт принадлежит его первому директору Умирсерику Касенову, дипломату по образованию и опытному международнику. Постепенно институт набирал опыт, рос его авторитет, в том числе и международный.
11 апреля 2014 года указом президента Казахстана Нурсултана Назарбаева было принято решение о передислокации КИСИ в Астану. А возведенное в неоклассическом стиле прекрасное сооружение расположенное по ул. Махатма Ганди, 10, продолжает радовать глаз жителей и гостей города.
В настоящее время в здании находится «Фонд Первого Президента Республики Казахстан – Лидера Нации», при нем «Институт мировой экономики и политики» и «Общественный фонд поддержки талантов».
