В заказнике наиболее распространены верховые болота. Наиболее живописен на Сестрорецком болоте верховой грядово-озерковый комплекс. Мощность торфа здесь достигает 5 метров. Многочисленные озерки у своих берегов поросли осоками и пушицей. Этот ландшафт практически не изменился за последнюю тысячу лет, что делает его уникальным.
Болотные сообщества хрупкие и уязвимые. Растения здесь растут медленно, и даже простой след человека будет зарастать на болоте очень долго.
